Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms