Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FAM3DQ96BQ1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3DQ96BQ1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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