Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF2Q8IX21 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms