Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALFQ53S48 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms