Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms