Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms