Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL7P80098 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms