Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPL23P62829 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPL23P62829 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPL23P62829 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPL23P62829 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPL23P62829 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPL23P62829 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPL23P62829 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms