Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms