Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3P09919 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3P09919 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3P09919 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3P09919 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3P09919 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3P09919 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3P09919 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3P09919 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms