Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms