Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms