Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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