Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms