Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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