Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C11orf49Q9H6J7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms