Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCO6Q96DC7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms