Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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