Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HAPLN4Q86UW8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms