Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms