Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDR2Q16832 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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