Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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