Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME3Q13232 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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