Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms