Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms