Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERFP50548 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms