Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHI3L1P36222 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms