Protein–RNA interactions for Protein: P30039

PBLD, Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBLDP30039 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PBLDP30039 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PBLDP30039 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PBLDP30039 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PBLDP30039 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PBLDP30039 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms