Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms