Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBP07199 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBP07199 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBP07199 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBP07199 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms