Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCG5P05408 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCG5P05408 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms