Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OPN1LWP04000 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OPN1LWP04000 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OPN1LWP04000 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OPN1LWP04000 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1LWP04000 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms