Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms