Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms