Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT8L2Q96SF2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms