Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGAM5Q96HS1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGAM5Q96HS1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms