Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPTSSAQ969W0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPTSSAQ969W0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPTSSAQ969W0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSAQ969W0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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