Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms