Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S1Q92572 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S1Q92572 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP3S1Q92572 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms