Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM164Q5U3C3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms