Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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KRTAP27-1Q3LI81 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP27-1Q3LI81 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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