Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms