Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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