Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.296e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.276e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 WBP2-205ENST00000586257 676 ntTSL 315.51■□□□□ 0.076e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 WBP2-216ENST00000591831 1406 ntTSL 513.6□□□□□ -0.236e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 WBP2-207ENST00000587642 3718 ntTSL 28.94□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ATP2B4-207ENST00000484746 4697 ntTSL 1 (best)5.49□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 THRA-205ENST00000577288 581 ntTSL 424.19■■□□□ 1.465e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 THRA-210ENST00000585047 574 ntTSL 423.22■■□□□ 1.315e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 THRA-208ENST00000578218 907 ntTSL 422.86■■□□□ 1.255e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 RAD21-209ENST00000523547 908 ntTSL 321.13■□□□□ 0.972e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PHLDB1-221ENST00000532639 748 ntTSL 515.97■□□□□ 0.157e-8■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 RAD21-208ENST00000522699 548 ntTSL 315.68■□□□□ 0.12e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ATRX-211ENST00000623321 1860 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.078e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PHLDB1-228ENST00000621027 1318 ntTSL 214.6□□□□□ -0.077e-8■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ATRX-217ENST00000624668 583 ntTSL 514.33□□□□□ -0.128e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 RAD21-202ENST00000517485 874 ntTSL 314.11□□□□□ -0.152e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 AC025165.3-203ENST00000546504 373 ntAPPRIS P1 TSL 212.77□□□□□ -0.372e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-203ENST00000434359 589 ntTSL 312.48□□□□□ -0.412e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-206ENST00000497617 770 ntTSL 312.44□□□□□ -0.422e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 AC025165.3-202ENST00000553083 332 ntTSL 212□□□□□ -0.492e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PHLDB1-217ENST00000530708 874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.517e-8■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.578e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SIRT1-204ENST00000432464 3587 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 AC138965.2-201ENST00000502813 568 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.642e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ATRX-213ENST00000624032 3071 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.658e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 RAD21-206ENST00000519837 515 ntTSL 49.51□□□□□ -0.892e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-209ENST00000548851 794 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.92e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 NUMB-208ENST00000554014 1714 ntTSL 28.93□□□□□ -0.981e-21■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-202ENST00000417094 558 ntTSL 48.63□□□□□ -1.032e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 THOC3-202ENST00000432305 453 ntTSL 28.62□□□□□ -1.032e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SLC41A1-202ENST00000468057 3777 ntTSL 27.73□□□□□ -1.172e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PHLDB1-211ENST00000527259 495 ntTSL 37.62□□□□□ -1.197e-8■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MNAT1-205ENST00000554641 596 ntTSL 37.33□□□□□ -1.242e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 TSFM-205ENST00000457189 689 ntTSL 36.95□□□□□ -1.32e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 RAD21-205ENST00000519469 549 ntTSL 26.63□□□□□ -1.352e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 RAD21-207ENST00000520992 831 ntTSL 46.62□□□□□ -1.352e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 NUMB-218ENST00000555859 906 ntTSL 25.68□□□□□ -1.51e-21■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 NUMB-226ENST00000557486 619 ntTSL 35.67□□□□□ -1.51e-21■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 NUMB-207ENST00000553997 713 ntTSL 35.47□□□□□ -1.531e-21■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.87e-8■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.961e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.021e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 THOC3-211ENST00000515016 250 ntTSL 31.99□□□□□ -2.092e-11■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-205ENST00000546481 561 ntTSL 321.4■■□□□ 1.024e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-227ENST00000552007 434 ntTSL 320.43■□□□□ 0.864e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-226ENST00000551892 748 ntTSL 320.43■□□□□ 0.864e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.684e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.684e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-207ENST00000547062 571 ntTSL 219.22■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-214ENST00000548714 567 ntTSL 218.81■□□□□ 0.64e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-232ENST00000553162 575 ntTSL 218.61■□□□□ 0.574e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-208ENST00000547501 510 ntTSL 218.09■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-223ENST00000551431 559 ntTSL 417.74■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-217ENST00000549074 532 ntTSL 417.74■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-225ENST00000551842 662 ntTSL 217.74■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-221ENST00000550449 739 ntTSL 317.3■□□□□ 0.364e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-213ENST00000548674 749 ntTSL 514.27□□□□□ -0.134e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 MARS-210ENST00000548146 558 ntTSL 412.3□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.282e-8■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-8■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 C19orf48-207ENST00000596655 1639 ntTSL 218.89■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 C19orf48-210ENST00000598463 1844 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 C19orf48-212ENST00000600373 709 ntTSL 212.51□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 C19orf48-206ENST00000596554 727 ntTSL 311.84□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 C19orf48-211ENST00000599004 866 ntTSL 511.07□□□□□ -0.643e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 C19orf48-205ENST00000596287 827 ntTSL 210.93□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 C19orf48-204ENST00000595794 941 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.182e-10■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-10■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PLEKHB1-205ENST00000426191 2022 ntTSL 219.54■□□□□ 0.722e-10■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-10■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-10■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 GNB1-206ENST00000471354 1512 ntTSL 515.12■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 GNB1-205ENST00000461893 2438 ntTSL 214.08□□□□□ -0.167e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.175e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.525e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.625e-7■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 CCNT1-202ENST00000417344 2017 ntTSL 26.03□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 HMBOX1-209ENST00000522468 817 ntTSL 312.95□□□□□ -0.342e-9■■■■□ 21.7
PCBP2Q15366 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-7■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.733e-7■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.271e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 21.6
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