Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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