Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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