Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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