Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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