Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APBA1Q02410 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms