Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms